1.#gStore-weekly | gstore源码解析（一）：基于boost的源码gstore http服务源码解析
2.github是什么平台？
3.PICRUSt2在微生物功能预测分析中的应用解读
4.pgAdmin4 - 搞定源码架构
5.UE5.1卡通渲染管线修改 学习笔记（改源码版）
6.github是什么
#gStore-weekly | gstore源码解析（一）：基于boost的gstore http服务源码解析
gStore, 由北京大学王选计算机所数据管理实验室的邹磊教授团队开发的图数据库系统，专门针对知识图谱设计，图谱旨在高效管理大量关联数据。生成图谱学苑的源码技术分享系列将推出gStore源码深度解析系列，目标是图谱帮助内核开发者和图数据库研究者理解系统内部构造。系列将逐步深入，生成myhdl源码从外部到核心，源码由易入难，图谱以SERVER服务为核心，生成剖析其启动、源码参数处理、图谱线程池管理和HTTP请求解析等关键环节。生成
首先，源码ghttp模块基于Ole Christian Eidheim的图谱Simple-Web-Service构建，提供一个基于Boost.Asio的生成轻量级HTTP服务器。服务启动时，采用fork创建子进程，主进程作为守护进程，确保服务的稳定运行。通过命令行参数，用户可以指定HTTP服务监听端口和预加载数据源。
ghttp通过线程池技术实现多线程服务，个线程预设，HttpServer负责接收所有请求，而query接口则有其独立的子线程池。每个请求都会在子线程中独立处理，参数处理包括GET请求的URLEncode/Decode和POST请求的JSON格式解析。
在request_thread方法中，接口参数的discuz视频站源码提取和校验是核心环节，但安全机制的详细实现将在后续章节深入讨论。阅读时，结合Main/ghttp.cpp源码将有助于理解。下篇文章将聚焦于核心接口如build、load、query的具体实现逻辑解析。
github是什么平台？
github是软件项目托管平台。GitHub是一个面向开源及私有软件项目的托管平台，因为只支持Git作为唯一的版本库格式进行托管，故名GitHub。GitHub拥有1亿以上的开发人员，万以上组织机构和3.3亿以上资料库。
GitHub于年4月日正式上线，除了Git代码仓库托管及基本的Web管理界面以外，还提供了订阅、讨论组、文本渲染、在线文件编辑器、协作图谱（报表）、代码片段分享（Gist）等功能。截止到--，其注册用户已经超过万，托管版本数量也是非常之多，其中不乏知名开源项目Ruby on Rails、jQuery、python等。
Github的特点
1、从代码自动化到云：使用GitHub Actions通过GitHub Packages和内置CI/CD更快地循环生产代码并简化工作流。期货软件公式源码
2、自动化工作流：在管理代码的同一个位置以所需方式生成、测试、部署和运行CI/CD。从任何GitHub事件到任何可用API触发Actions。使用所选语言生成Actions，或从社区创建的数千个工作流和Actions中进行选择。
3、带有代码的家庭包：使用Actions将新的包版本自动发布到GitHub Packages。在CI/CD工作流中安装托管在GitHub Packages或首选包注册表上的包和映像。它对于开放源代码始终免费，Actions内的数据传输对所有人都无限制。
PICRUSt2在微生物功能预测分析中的应用解读
微生物组学研究已超越菌群组成分析，广泛应用于多种领域。人类微生物组研究揭示肠道微生物组功能变化对炎症和免疫反应的关键影响。传统上，S rRNA分析作为微生物组研究的常用技术，用于菌群组成分析，但标记基因测序无法直接提供群落功能信息。因此，生物信息学工具应运而生，利用S rRNA数据预测微生物组功能。
PICRUSt2作为流行的微生物功能预测工具之一，能够生成整个群落通路丰度。此工具基于基因家族，如KEGG同源基因和酶分类号，预测任意特性。它通过比较已测细菌基因组与未测物种基因功能谱，isc dhcp server 源码构建基因功能预测谱，最后将菌群组成“映射”到数据库中，预测菌群代谢功能。
相较于早期的PICRUSt1，PICRUSt2具有更准确、更全面的数据库。它无需以特定的OTU表为输入，允许直接读取OTU的代表序列并自动完成物种注释。此外，其参考基因组数据库规模显著扩大，可与任何可操作的分类单位（OTU）筛选或去噪算法兼容，并能够进行表型预测。基准测试显示，PICRUSt2比其他竞争方法更准确，并且允许用户添加自定义参考数据库。
PICRUSt2的工作流程集成现有开放源代码工具，预测环境采样的S rRNA基因序列的基因组。系统发生放置基于三个工具的输出，将研究序列放置到参考树中。使用更快的R包castor进行核心隐藏状态预测功能。生成元基因组图谱，通过贡献序列进行分层，并基于此预测途径丰度。
PICRUSt2结果包括对酶分类（EC）、KEGG直系同源物（KO）和MetaCyc途径丰度的预测。此外，还提供COG预测结果、PFAM功能域模块预测结果以及TIGRFAM功能域模块预测结果。企业投资源码这些预测结果通过丰度计算得到，依赖于S rRNA拷贝数标准化后的OTU丰度表。
数据库方面，KEGG是一个从基因组测序和其他高通量实验技术产生的大规模分子数据库，以了解细胞、有机体和生态系统等生物系统的高级功能和效用。MetaCyc是一个包含非冗余且通过实验手段阐明过的代谢通路的数据库。CAZy是一个碳水化合物酶相关的专业数据库，包含碳水化合物酶家族的信息。
在使用过程中，可以参考KEGG.jp、metacyc.org/、cazy.org/和ncbi.nlm.nih.gov/COG/等数据库官网查询更详细的功能和生物学现象。KEGG与MetaCyc在代谢通路预测方面具有互补性，KEGG提供更广泛的通路汇总，而MetaCyc则提供更详细的代谢物信息。
谷禾健康是一家专注于利用高通量测序技术进行肠道菌群和精准健康检测的国家高新技术企业。成立于浙江大学，团队由浙江大学核心成员组成。谷禾在高通量基因测序领域独立研发多项技术，已授权多项国家发明专利和软件著作权。谷禾通过ISO认证，并建有II级病原微生物P2实验室，提供科研和检测服务。
谷禾构建了超过万例各类人群样本数据库，并自主构建了肠道菌群参考注释数据库，建立了基于近7万人群的肠道菌群人群分布及正常范围。在国际顶级学术期刊发表多项研究论文，支持合作多项临床开放基金项目，发表研究成果多项。谷禾的数据和人工智能平台能够更可靠和准确地反映菌群和健康状况。
pgAdmin4 - 搞定源码架构
pgAdmin4是一个强大的开源工具，专为PostgreSQL数据库管理而设计，它是pgAdmin3的现代化升级，遵循开放源码协议，免费且适用于商业用途。作为基于Python的Web应用程序，pgAdmin4支持两种部署模式：web浏览器访问的web模式和独立运行的桌面模式。
pgAdmin4的4.版本提供了详尽的功能图谱和系统架构，它是一个由Python编写的程序，源代码可以下载并深入了解其设计。源码结构清晰，核心组件在pgadmin包中，包含了Jinja引擎使用的HTML模板和全局静态文件，如图像、JavaScript和CSS，这些在__init__.py构造函数中初始化，负责设置日志和身份验证，以及动态加载其他模块。
pgAdmin4的功能扩展是通过模块实现的，这些模块作为Python类实例，继承自Web/pgadmin/utils.py中的PgAdminModule类，它是一个基于Flask的Blueprint。为了被pgAdmin4识别为有效模块，需要创建一个Python包，并遵循特定规则，如为模块定义template和static目录，避免名称冲突。
总的来说，pgAdmin4的源码架构设计巧妙，模块化使得功能扩展既灵活又有序，无论是开发人员还是数据库管理员，都能方便地管理和操作PostgreSQL数据库。
UE5.1卡通渲染管线修改 学习笔记（改源码版）
UE5.1的卡通渲染管线修改笔记
起始于提升MMD制作质量的需求，从C4D的octane到Blender的Eevee和Cycle，再到现在的UE5，探索了各种卡渲方法，包括后处理和自发光。现在转向直接修改源码，回顾过去发现自己的学习路径混乱，缺乏记录，因此决定补写这篇学习笔记，以供参考。
在探索过程中，我借鉴了前辈们在卡通渲染领域的成果，通过预加载ToonShaderShadowAtlas和ToonShaderSpecularAtlas两个曲线图谱，以及相应的Sampler和高度参数。添加ShadingModel时，我选择了Toon、ToonSSP和ToonSDF，涉及了阴影重映射、高光重映射，以及整体阴影着色的优化。
对于KajiyaKai高光，我利用Anisotropy作为输入，并通过一个参数控制是否启用。SDF阴影着色方面，尝试将算法内置Shader以解决现有问题，尽管初期尝试受限。扩展GBuffer以适应新增ShadingModel的需求，特别关注了ToonData的处理。
在Material文件夹中，我创建了MaterialExpressionToonShaderCustomOutput，结合ToonCurve选择、环境反射、SDF输入等功能，实现了定制化的输出。同时，我还注意到了Lumen修正和BackFace方案的选用。
UE5.1版本中，修改CreateToonOutLinePassProcessor是关键步骤，以处理超过个Pass的问题。尽管扩展ShadingModel上限的方案暂未使用，但已做了相关笔记，涉及GBufferInfo、ShaderGenerationUtil和EngineType的改动。
总结来说，本文记录了从理论学习到实践应用的UE5.1卡通渲染管线修改过程，供后来者参考和学习。
github是什么
github是托管平台，专门用于存储代码、软件等等资源和信息的。github在年出现，最开始大家会将自己编写的源代码、图谱、文件编辑器防止这里，后来用户数量不断增加，现在已经有万用户，且托管的数量越来越多，它现在属于微软旗下。github是什么
1、github是开源代码库，与我们现在看到的各种云服务比较相似，它能够存储很多东西，比如软件、代码片段、文本渲染、报表等等，很多世界上非常有名的开源项目也会托管在这里，并且为其他的用户服务。
2、github的创始人是汤姆普雷斯顿-维尔纳、克里斯万斯特拉斯，通过十多年的运营，它已经是世界上最有影响力的开源代码库，并且在年的时候被微软收购，因此现在它是微软旗下的，微软为收购支付了亿美元的费用。
3、github在年的时候就已经有完开发者，并且它还在不断的壮大，在年的时候，github收购了NPM。在年和年的时候，github曾受到过黑客入侵，且资源库曾被擦除，不过现在已经基本恢复正常。
github是干什么的
github的主要功能就是托管、分享，它可以让用户在这里存储开源代码，并且将这些代码分享给其他人，由于是开源的，因此并不违反规定。它还可以帮助人们在这里找到自己想要的开源代码，通过它来进行配置管理。
github是哪个国家的公司
github是美国公司，因为它在年已经归入微软旗下，所以它现在隶属于美国。在年的6月4日，微软用亿美元的股票收购了github，从此它的名声更加显赫。在收购之后，github的CEO也从原本的创始人变为微软的开发者服务副总裁，负责这个托管平台的运营。
