1.转-matlab读取hdf5

转-matlab读取hdf5

       MATLAB读取hdf文件

       ments'

        Dataset'comments'

        Size:

        MaxSize:

                        Datatype:  H5T_STRING

        StringLength: variable

                            Padding: H5T_STR_NULLTERM

        CharacterSet: H5T_CSET_UTF8

                            Character Type: H5T_C_S1

                        ChunkSize:  []

                        Filters:  none

        Dataset'target_ids'

        Size:

        MaxSize:

                        Datatype:  H5T_STD_ULE (uint)

                        ChunkSize:  []

                        Filters:  none

        FillValue:0

        Group'/annotations/presynaptic_site'

        Dataset'partners'

        Size:2x

        MaxSize:2x

                        Datatype:  H5T_STD_ULE (uint)

                        ChunkSize:  []

                        Filters:  none

        FillValue:0

        Group '/volumes'

        Dataset 'raw'

        Size:xx

        MaxSize:xx

                    Datatype:  H5T_STD_U8LE (uint8)

        ChunkSize:xx7

        Filters:  deflate(4)

                    Attributes:

        'resolution':  . 4. 4.

        Group'/volumes/labels'

        Dataset'clefts'

        Size:xx

        MaxSize:xx

                        Datatype:  H5T_STD_ULE (uint)

        ChunkSize:xx4

        Filters:  deflate(4)

                        Attributes:

        'resolution':  . 4. 4.

        'offset':  . . .

        Dataset'neuron_ids'

        Size:xx

        MaxSize:xx

                        Datatype:  H5T_STD_ULE (uint)

        ChunkSize:xx4

        Filters:  deflate(4)

                        Attributes:

        'resolution':  . 4. 4.

        'offset':  . . .

        1

       2. 读取hdf文件中的数据

        data= h5read('文件名.hdf',码下nodepad++源码'数据集名');

        1

        例如：

        raw = h5read('dataset/sample_A_padded_.hdf',' /volumes/raw ');

        1

       3. 读取数据集的属性

        attribute = h5readatt('文件名.hdf','数据集名','属性名');

        1

        例如：

        resolution = h5readatt('dataset/sample_A_padded_.hdf','/volumes/raw','resolution');

        1

       4. 创建hdf文件

        h5create('文件名.hdf','数据集名', 数据大小,'Datatype','数据类型');

        1

        例如：

        h5create('downs_dataset/downsample_A_padded_.hdf','/volumes/raw', size_downs_raw,'Datatype','uint8');

        1

       5. 往新建的hdf中写入数据

        h5write('文件名.hdf','数据集名', 数据变量);

        1

        例如：

        h5write('downs_dataset/downsample_A_padded_.hdf','/volumes/raw', downs_raw);

        1

       6. 给数据集写属性

        h5writeatt('文件名.hdf','数据集名','属性名', 属性变量);

        1

        例如：

        h5writeatt('downs_dataset/downsample_A_padded_.hdf','/volumes/raw','resolution', resolution);

        1