RASPA教程之安装编译
RASPA,编译php源码超市由西北大学Snurr组开发的源码多用途计算软件,适用于气体、编译液体、源码分子筛、编译硅铝酸盐、源码金属有机骨架材料的编译分子动力学(MD)及蒙特卡洛模拟(MC),尤其擅长高通量气体吸附计算。源码易语言 挂q源码
编译及安装RASPA需先确保C编译器安装,编译推荐gcc或icc。源码fftw、编译blas、源码lapack为可选组件,飞鸽传书 android 源码但建议一并安装以优化性能。通过GitHub等平台下载RASPA的最新源代码。
安装前,需在${ HOME}/.bashrc文件中设置RASPA_dir环境变量,指定RASPA的微信商城源码 下载安装位置。完成配置后,进入RASPA源代码目录,执行编译指令。
运行RASPA时,需要准备两个文件:run文件与input文件,手机网页源码查看后者必须命名为simulation.input,内含模拟所需参数。这两个文件应放置于同一目录。在终端输入bash run命令启动模拟。
模拟生成的数据保存于../Output/System_0/output_Box_1.1.1_._0.data路径下。可通过文本方式打开数据文件。在高通量计算中,使用编程工具批量读取数据,实现高效数据分析。
各位网友,请教个问题:我把lapack内部的库函数的程序代码找到了,并作为子函数调用,为何速度就慢多了?
我是一个C coder,也碰到楼主类似的问题,我将我的处理方法说一下:
1. 编译器中的优化选项选为Maximize speed,在C编译器中是O2;
2. 将所有source code中的static参数变成local变量;
如果以上方法还不行的话,查看LAPACK函数所调用的BLAS子函数是不是经过了优化的,如果它本身调用的是tuned BLAS,即使你用的是LAPACK的源码,性能也不如调用BLAS优化库的函数的。
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