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1.序列比对(二)
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序列比对(二)
生物学的基石在于同源性,正如David Wake在年《科学》杂志上所述。源码序列比对是源码探讨这一核心问题的重要手段。上一篇笔记简要概述了比对的源码商品溯源码如何查基本原理,接下来,源码我将深入介绍几种常用的源码比对工具,并重点解析BLAST的源码基本理念。由于篇幅限制,源码这里主要关注在线工具,源码未来或许会针对某些软件如BLAST进行本地化安装的源码探讨,前提是源码抖音秒杀源码能在Linux环境下运行。
多序列比对(MSA)是源码处理多个序列对齐的关键。其中,源码Clustal Omega是源码一个系列的开源工具,由C++编撰,源码官网提供最新版本和源码。时价共振指标源码Clustal Omega支持蛋白质、DNA和RNA序列比对,接受多种格式输入,如NBRF/PIR、FASTA等,大猿人系统源码输出格式包括Clustal、NEXUS等。EBI推荐使用Clustal Omega进行蛋白质序列的比对,详情请访问其官网。
Muscle,vc 股票 k 源码另一种多序列比对程序,同样开源,适用于蛋白质和核酸序列。它也有web server版本,由EBI提供,特别推荐用于DNA序列比对,点击链接了解详情。
还有更多多序列比对软件可供选择,详情请查阅相关资料。
至于双序列比对(PSA),虽然这部分内容在某个页面已有详述,这里不再赘述。
而对于BLAST(基本局部序列比对工具),尽管其算法深入探讨可能意义不大,但这里提供参考链接。未来有机会会专门介绍BLAST的网页应用和本地化使用,但目前暂无详述。
上文所述的内容需要时间沉淀和改进,敬请期待更详尽的分析。
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