1.GeneWise 简介及安装方法
GeneWise 简介及安装方法
Genewise是源码Wise2软件的核心程序,主打功能为蛋白质序列与DNA序列比对,源码预测DNA序列编码区域。源码Ensembl的源码创客空间源码pipeline程序表明其应用广泛,尽管开发已有多年历史,源码仍深受多家公司青睐用于基因组注释。源码微信 自动 签到源码
安装Genewise流程如下:
首先,源码访问官方下载地址~birney/wise2...>,源码使用wget进行下载。源码
$ wget ebi.ac.uk/~birney/wise2...
解压tar.gz文件:
$ tar -zxvf wise2.4.1.tar.gz
进入src目录进行源代码相关修改:
$ cd wise2.4.1/src
将所有makefile中的源码glib-config替换为glib-2.0。
$ find . -name makefile | xargs sed -i 's/glib-config/pkg-config glib-2.0/'
更新函数名,源码如getline和isdigit。源码
$ perl -p -i -e's/getline/getline_ReadSeqVars/g' ./HMMer2/sqio.c
$ perl -p -i -e 's/isnumber/isdigit/'models/phasemodel.c
将csh脚本替换为sh脚本。源码易语言如何看源码
$ perl -p -i-e's/csh welcome.csh/sh welcome.csh/' makefile
进行编译。源码
$ make all
编译完成,源码系统会显示相关路径,mmo 手游 源码 完整进行环境配置:
$ export WISECONFIGDIR=/public/home/lvqiang/software/wise2.4.1/wisecfg/
可选是否加入环境变量,进入bin目录验证安装情况:
$ ./genewise -help
显示帮助信息,确认安装成功。龙猫传奇 源码下载
具体参数、使用方法及结果解读,待实际数据应用时,再深入撰写详细教程。
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